Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CREB3O43889 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CREB3O43889 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms