Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KNCNA6PVL3 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KNCNA6PVL3 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms