Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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