Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNRF3Q9ULT6 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRF3Q9ULT6 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms