Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DKK3Q9UBP4 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
DKK3Q9UBP4 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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