Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AL157823.2-201ENST00000452048 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SMARCB1-203ENST00000407082 1182 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TRAIP-202ENST00000469027 1145 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 CR936218.2-201ENST00000574252 759 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PCDH10Q9P2E7 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 AC010335.3-201ENST00000623767 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCDH10Q9P2E7 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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