Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRTQ9BXP5 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms