Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNFT2Q96EX2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNFT2Q96EX2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNFT2Q96EX2 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNFT2Q96EX2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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