Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SCG3Q8WXD2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms