Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHD5Q8TDI0 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHD5Q8TDI0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHD5Q8TDI0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHD5Q8TDI0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHD5Q8TDI0 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHD5Q8TDI0 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CHD5Q8TDI0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHD5Q8TDI0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHD5Q8TDI0 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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