Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO3Q8TAP4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO3Q8TAP4 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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