Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC50Q8IVM0 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC50Q8IVM0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms