Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SYT9Q86SS6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms