Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HS2ST1Q7LGA3 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HS2ST1Q7LGA3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms