Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC38Q502W7 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms