Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CCDC85BQ15834 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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