Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PWP1Q13610 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PWP1Q13610 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PWP1Q13610 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PWP1Q13610 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PWP1Q13610 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
PWP1Q13610 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
PWP1Q13610 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
PWP1Q13610 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
PWP1Q13610 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms