Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TOP3AQ13472 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
TOP3AQ13472 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms