Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CREMQ03060 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CREMQ03060 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CREMQ03060 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms