Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CDC42EP1Q00587 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms