Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SSFA2P28290 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms