Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LMO2P25791 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LMO2P25791 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LMO2P25791 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms