Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AL121894.1-201ENST00000450971 436 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPRGP23470 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms