Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PRG2P13727 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PRG2P13727 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PRG2P13727 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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PRG2P13727 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PRG2P13727 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRG2P13727 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRG2P13727 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRG2P13727 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRG2P13727 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PRG2P13727 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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