Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTN1P12814 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ACTN1P12814 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms