Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC175P0C221 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC175P0C221 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms