Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
F9P00740 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
F9P00740 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
F9P00740 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.05■□□□□ -0
F9P00740 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F9P00740 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F9P00740 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F9P00740 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
F9P00740 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
F9P00740 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
F9P00740 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms