Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GOLGA8SH3BPF8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms