Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
USP15Q9Y4E8 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP15Q9Y4E8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms