Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TCAF1Q9Y4C2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TCAF1Q9Y4C2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TCAF1Q9Y4C2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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