Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDH22Q9UJ99 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms