Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PACSIN1Q9BY11 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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