Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CHFRQ96EP1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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