Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC174Q6PII3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC174Q6PII3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms