Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ANKRD40Q6AI12 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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