Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DUSP28Q4G0W2 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DUSP28Q4G0W2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms