Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXD4L6Q3SYB3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms