Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LETM2Q2VYF4 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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