Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FSCN1Q16658 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms