Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GABRA6Q16445 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms