Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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SEC23BQ15437 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SEC23BQ15437 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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