Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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LAPTM4AQ15012 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
LAPTM4AQ15012 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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