Protein–RNA interactions for Protein: Q14721

KCNB1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNB1Q14721 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNB1Q14721 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms