Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMC1AQ14683 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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