Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LAMB3Q13751 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms