Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CUL3Q13618 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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CUL3Q13618 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CUL3Q13618 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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