Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CAMK2DQ13557 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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