Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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FOXE3Q13461 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
FOXE3Q13461 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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