Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRDM2Q13029 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRDM2Q13029 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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