Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PTP4A2Q12974 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTP4A2Q12974 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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